Amazonės upės baseinas, į kurį įeina Amazonės atogrąžų miškai, užima beveik tris milijonus kvadratinių mylių ir sutampa devynių šalių ribos: Brazilija, Kolumbija, Peru, Venesuela, Ekvadoras, Bolivija, Gajana, Surinamas ir Prancūzijos Gviana. Kai kuriais skaičiavimais, šiame regione gyvena dešimtadalis pasaulio gyvūnų rūšių. Juose yra viskas, pradedant beždžionėmis ir tukanais, baigiant priešpiečiais ir nuodingų lėkščių varlėmis.
Yra daugybė mitų apie piranijas, pavyzdžiui, mintis, kad jie gali skepti karvę per mažiau nei penkias minutes. Faktas yra tas, kad šios žuvys net nelabai mėgsta pulti žmones. Vis dėlto negalima paneigti, kad piranė yra pastatyta žudyti, įrengta kaip aštriais dantimis ir ypač galingi žandikauliai, galintys užmušti grobį, kai jėga viršija 70 svarų kvadratiniam colių. Dar baisesnis yra megapiranha, milžiniškas piratų protėvis, kuris persekiojo Miocenas Pietų Amerika.
Svoris iki 150 svarų, kapibara yra didžiausia pasaulyje graužikas. Jis plačiai paplitęs visoje Pietų Amerikoje, tačiau gyvūnui ypač patinka šiltos, drėgnos Amazonės upės baseino apylinkės. Kapibara išgyvena gausias lietaus miško augmenijas, įskaitant vaisius, medžio žievę ir vandens augalus, ir žinoma, kad ji kaupiasi bandose, kuriose yra iki 100 narių. Lietaus miškui gali kilti pavojus, tačiau kapybara nėra; šis graužikas ir toliau klesti, nepaisant to, kad jis yra populiarus meniu punktas kai kuriuose Pietų Amerikos kaimuose.
Trečia pagal dydį katė po liūto ir tigro, jaguaras sunkiai išgyveno praėjusį šimtmetį, nes miškų naikinimas ir žmonių kišimasis apribojo gyvūnų diapazoną per pietus Amerika. Tačiau medžioti jaguarą tankiame Amazonės upės baseine yra daug sunkiau nei lauke esančiose pampose, todėl nenugalimos lietaus miško dalys gali būti Pantera oncapaskutinė, geriausia viltis. Niekas to nežino, tačiau Amazonės lietaus miško megafaunoje žūsta bent keli tūkstančiai jaguarų; viršūninis plėšrūnas, jaguaras neturi ko bijoti savo bendradarbių gyvūnų (išskyrus, žinoma, žmones).
Taip pat žinomos kaip „vandens jaguarai“ arba „upių vilkai“. Milžiniškos ūdros yra didžiausios mustelidų šeimos narės ir glaudžiai susijusios su weasels. Patinai gali užaugti iki šešių pėdų ilgio ir sverti iki 75 svarų, o abi lytys yra žinomos dėl storo, blizgaus paltai - kuriuos medžiotojai taip trokšta, kad visoje Amazonėje liko tik apie 5000 milžiniškų ūdrų Upės baseinas. Neįprasta mustelidėms (bet brakonierių laimei) milžinė ūdra gyvena išplėstinėse socialinėse grupėse, susidedančiose iš maždaug pusės tuzinų individų.
Toks didelis, kad kartais žinomas kaip skruzdėlių lokys, milžiniškas skruzdėlynas turi komiškai ilgą snukį, idealiai tinkantį įsikibti į siaurus vabzdžių urvus, ir ilgą, kupiną uodegą; kai kurie asmenys gali priartėti prie 100 svarų svorio. Kaip ir daugeliui atogrąžų Pietų Amerikos plius dydžio žinduolių, milžiniškam skruzdėlynui yra didelis pavojus. Laimei, didžiulis, pelkėtas, nepralaidus Amazonės upės baseinas suteikia likusiems gyventojams tam tikrą apsaugos nuo žmonių lygį (jau nekalbant apie neišsenkamą skoningų skruzdžių tiekimą).
Dar žinomas kaip auksinis marmosetas, auksinis liūtas tamarinas siaubingai nukentėjo nuo žmonių kėsinimosi. Kai kuriais skaičiavimais, ši Naujojo pasaulio beždžionė prarado didžiulį 95 procentų savo Pietų Amerikos buveinių nuo to laiko, kai prieš 600 metų atvyko Europos gyventojai. Auksinis liūtas tamarinas sveria tik porą svarų, todėl jo išvaizda dar ryškesnė: raudonai rudų plaukų kupinas manekenas, supantis plokščią, tamsių akių veidą. (Išskirtinė šio primato spalva greičiausiai atsiranda dėl intensyvių saulės spindulių ir daugybės karotenoidų - baltymų, kurie morkas daro oranžines, dietos.)
Didžiausias ir pavojingiausias Amazonės upės baseino roplys juodasis kaimanas (techniškai aligatoriaus rūšis) gali priartėti prie 20 pėdų ilgio ir sverti iki pusės tonos. Būdami juodosios, drėgnos ekosistemos viršūniniai plėšrūnai, juodieji kaiminai valgys beveik viską, kas juda, pradedant žinduoliais ir paukščiais, ir baigiant jų ropliais. Aštuntajame dešimtmetyje juodajam kaimanui buvo padaryta rimta grėsmė - žmonėms buvo skirta dėl mėsos ir vertingos odos, tačiau nuo to laiko jo populiacija vėl išaugo.
Paprastai kuo ryškesnės spalvos nuodingoji varlė varlė, tuo galingesnis jos nuodas, todėl Amazonės upės baseino plėšrūnai būna atokiau nuo žėrinčių žaliųjų ar oranžinių rūšių. Šios varlės negamina savo nuodų, bet renka jas iš skruzdėlių, erkių ir kitų vabzdžių, kurie sudaro juos dieta (tai patvirtina faktas, kad nelaisvėje laikomos nuodingų lėkščių varlės, kurios šeriamos kitų rūšių maistu, yra kur kas mažiau pavojinga). Šio varliagyvio vardo „lėkti“ dalis kyla iš to, kad vietinės gentys visoje Pietų Amerikoje panardina savo medžioklės strėles į jos nuodalą.
Vienas iš labiau komiškos išvaizdos Amazonės upės baseino gyvūnų, tobulas su kilimėliais išsiskiria didžiuliu, daugiaspalviu vekseliu, kuris iš tikrųjų yra daug lengvesnis nei atrodo iš pirmo žvilgsnio (likusi šio paukščio spalva yra palyginti silpna, išskyrus geltoną kaklas). Skirtingai nuo daugelio šiame sąraše nurodytų gyvūnų, tujanas, kurio kalba yra kilis, toli gražu nėra nykstantis. Paukštis apyniauja nuo medžio šakos iki medžio šakos mažuose pulkų nuo 6 iki 12 individų, vyrai patina kiti su savo išsikišusiomis snozomis poravimosi sezono metu (ir, ko gero, nesukels visos partijos) žala).
Prieš milijonus metų, per Pleistocenas epocha, Pietų Amerikos lietaus miškuose gyveno milžiniškos, kelių tonų apimties liūdesys Megatheris. Šiandien vienas iš labiausiai paplitusių Amazonės upės baseino tingumų yra trijų pakopų tinginys, Bradypus tridactylus, kuriam būdingas žalsvas, dumbliais išpjaustytas kailis, gebėjimas plaukti, trys pirštai ir agonizuojantis lėtumas - vidutinis šio žinduolio greitis nustatytas maždaug dešimtos mylios per minutę greičio valanda. Trispirštis tinginys egzistuoja kartu su dvilypiu slūgiu, ir šie du gyvūnai kartais netgi dalijasi tuo pačiu medžiu.