Yra daugybė įrodymų rūšių, pagrindžiančių evoliucijos teoriją. Šie įrodymai svyruoja nuo mažiausio molekulinio DNR panašumo lygio iki pat organizmų anatominės struktūros panašumų. Kada Charlesas Darwinas pirmasis pasiūlė savo idėją natūrali atranka, jis daugiausia naudojo įrodymus, pagrįstus anatominiai bruožai organizmų, kuriuos jis tyrė.
Šie anatominių struktūrų panašumai gali būti klasifikuojami dviem būdais analogiškos struktūros arba homologinės struktūros. Nors abi šios kategorijos susijusios su tuo, kaip naudojamos ir struktūrizuojamos skirtingų organizmų panašios kūno dalys, tik viena iš tikrųjų yra bendro protėvio ženklas kažkur praeityje.
Analogija
Analogija arba analogiškos struktūros iš tikrųjų yra tos, kurios nereiškia, kad tarp dviejų organizmų yra neseniai egzistuojanti protėvis. Nors tiriamos anatominės struktūros atrodo panašios ir netgi atlieka tas pačias funkcijas, jos iš tikrųjų yra produkto produktas konvergentiška evoliucija. Vien todėl, kad jie atrodo ir elgiasi vienodai, dar nereiškia, kad jie yra glaudžiai susiję su gyvenimo medžiu.
Konvergentiška evoliucija yra tada, kai dvi nesusijusios rūšys patiria keletą pakeitimų ir prisitaikymų, kad taptų panašesnės. Paprastai šie du rūšių gyvename panašiame klimate ir aplinkoje skirtingose pasaulio vietose, palankiose toms pačioms adaptacijoms. Analogiškos savybės padeda rūšims išlikti aplinkoje.
Vienas iš analogiškų struktūrų pavyzdžių yra šikšnosparnių, skraidančių vabzdžių ir paukščių sparnai. Visi trys organizmai skraidydami naudoja sparnus, tačiau šikšnosparniai iš tikrųjų yra žinduoliai ir nėra susiję su paukščiais ar skraidančiais vabzdžiais. Tiesą sakant, paukščiai yra labiau susiję su dinozaurais nei su šikšnosparniais ar skraidančiais vabzdžiais. Paukščiai, skraidantys vabzdžiai ir šikšnosparniai prisitaikė prie savo aplinkos nišų, kurdami sparnus. Tačiau jų sparnai nerodo glaudaus evoliucinio ryšio.
Kitas pavyzdys yra ryklio ir delfinų pelekai. Rykliai yra klasifikuojami žuvų šeimoje, o delfinai yra žinduoliai. Tačiau abu gyvena panašioje aplinkoje, vandenyne, kur pelekai yra palankios adaptacijos sąlygos gyvūnams, kuriems reikia plaukti ir judėti vandenyje. Jei jie atsekti pakankamai toli ant gyvybės medžio, ilgainiui atsiras bendras protėvis dviese, bet tai ne laikomi naujausiu protėviu, todėl ryklio ir delfinų pelekai laikomi analogiškomis struktūromis.
Homologija
Kviečiama kita panašių anatominių struktūrų klasifikacija homologija. Homologijoje homologinės struktūros iš tikrųjų išsivystė iš neseniai paplitusio protėvio. Organizmai su homologinis struktūros yra labiau susijusios viena su kita gyvybės medyje nei tos, kurios turi analogiškas struktūras.
Tačiau jie vis dar yra glaudžiai susiję su nesenu protėviu ir greičiausiai išgyveno skirtinga evoliucija.
Dėl skirtingos evoliucijos artimai susijusios rūšys tampa mažiau panašios struktūros ir funkcijos dėl adaptacijos, kurias jos įgyja natūralios atrankos proceso metu. Migracija į naują klimatą, konkurencija dėl nišos su kitomis rūšimis, ir net mikroevoliuciniai pokyčiai patinka DNR mutacijos gali prisidėti prie skirtingos evoliucijos.
Homologijos pavyzdys yra žmonių uodegos kaulai su kačių ir šunų uodegomis. Nors mūsų coccyx arba tailbone tapo vestigialinė struktūra, katėms ir šunims uodegos vis dar nepažeistos. Galbūt nebeturime matomos uodegos, tačiau kaukolės struktūra ir atraminiai kaulai yra labai panašūs į mūsų naminių gyvūnėlių uodegos kaulus.
Augalai taip pat gali turėti homologiją. Dygliuoti spygliukai ant kaktuso ir lapai ant ąžuolo atrodo labai nevienodi, tačiau iš tikrųjų jie yra homologiškos struktūros. Jie net atlieka labai skirtingas funkcijas. Nors kaktusiniai spygliai yra pirmiausia skirti apsaugoti ir užkirsti kelią vandens praradimui karštoje ir sausoje aplinkoje, ąžuolas šių pritaikymų neturi. Abi struktūros prisideda prie jų augalų fotosintezės, tačiau ne visos naujausios protėvio funkcijos prarastos. Neretai organizmai, turintys homologinę struktūrą, iš tikrųjų atrodo labai skirtingi vienas nuo kito, palyginti su tuo, kaip arti viena kitos panašios struktūros rūšys.