Kai kalbama apie iškastinių medžiagų įrašą, Niujorkas atkreipė trumpą lazdos galą: imperijos valstijoje gausu mažų, jūroje gyvenančių bestuburių, datuojamų ankstyvuoju laikotarpiu. Paleozojaus era, prieš šimtus milijonų metų, bet gaunamas virtualus ruošinys dinozaurai ir megafauniniai žinduoliai. (Galite kaltinti santykinį Niujorko nuosėdų trūkumą, susikaupusį per Mezozojaus ir Cenozoinis Laikrodžiai.) Vis dėlto tai nereiškia, kad Niujorke visiškai nebuvo priešistorinio gyvenimo, kurio keletą žymių pavyzdžių galite rasti toliau pateiktose skaidrėse. (Matyti dinozaurų ir priešistorinių gyvūnų, atrastų kiekvienoje JAV valstijoje, sąrašas.)
Šiek tiek daugiau nei prieš 400 milijonų metų, per Siluras laikotarpiu didžioji Šiaurės Amerikos dalis, įskaitant Niujorko valstiją, buvo panardinta po vandeniu. Oficiali Niujorko fosilija „Eurypterus“ buvo jūrinių bestuburių rūšis, vadinama jūros skorpionu, ir buvo viena iš labiausiai bijomų povandeninių plėšrūnų prieš evoliucijos priešistoriniai rykliai
ir milžinas jūriniai ropliai. Kai kurie Eurypterus egzemplioriai užaugo iki beveik keturių pėdų ilgio, nykstant primityvioms žuvims ir bestuburiams, kuriuos jie grobė.Tai nėra gerai žinomas faktas, bet įvairus dinozaurų pėdsakai buvo aptikti netoli Blauvelt miestelio Niujorko Roklando apygardoje (netoli nuo Niujorko miesto). Šie takeliai datuojami vėlai Triaso laikotarpis, maždaug prieš 200 milijonų metų, ir yra keletas gąsdinančių įrodymų apie Koelofizė (dinozauras, labiausiai žinomas dėl savo paplitimo tolimoje Naujojoje Meksikoje). Laukdami įtikinamų įrodymų, kad šie pėdsakai iš tikrųjų buvo paguldyti iš coelophysis, paleontologai mieliau priskiria juos „ichnogenui“, vadinamam „Grallator“.
1866 m., Statant malūną Niujorko valstijoje, darbininkai aptiko beveik pilnus penkių tonų liekanas Amerikos „Mastodon“. „Cohoes Mastodon“, kaip tapo žinoma, liudija, kad šie milžinas priešistorinių dramblių maždaug prieš 50 000 metų klaidžiojo Niujorko platybėse bangos (be abejo, šalia jų artimo šiuolaikinio Pleistocenas epocha Vilnonis mamutas).
Kaip ir daugelis kitų rytų JAV valstijų, Niujorkas buvo gana drąsus, geologiškai kalbant, iki vėlyvosios pleistoceno epochos - kai ją apėmė visokios megafaunos žinduoliai, pradedant mamutais ir mastodonais (žr. ankstesnes skaidres), baigiant tokiomis egzotinėmis gentimis kaip Milžiniškas trumpaplaukis lokys ir Milžinas bebras. Deja, dauguma šių plius dydžio žinduolių išnyko praėjusio ledynmečio pabaigoje, pasidavę žmonių grobuoniui ir klimato pokyčiams.