Penkios bazės yra adeninas, guaninas, citozinas, timinas ir uracilas, kurie atitinkamai turi simbolius A, G, C, T ir U. Bazės pavadinimas paprastai naudojamas kaip nukleotido pavadinimas, nors tai techniškai neteisinga. Bazės sujungiamos su cukrumi, kad nukleotidai būtų adenozinas, guanozinas, citidinas, timidinas ir uridinas.
Nukleotidai yra įvardijami atsižvelgiant į fosfatų liekanų skaičių juose. Pavyzdžiui, nukleotidas, turintis adenino bazę ir tris fosfato liekanas, būtų pavadintas adenozino trifosfatu (ATP). Jei nukleotidas turi du fosfatus, tai būtų adenozino difosfatas (ADP). Jei yra vienas fosfatas, nukleotidas yra adenozino monofosfatas (AMP).
Nors dauguma žmonių sužino tik penkis pagrindinius nukleotidų tipus, yra ir kitų, įskaitant, pavyzdžiui, cikliniai nukleotidai (pvz., 3'-5'-ciklinis GMP ir ciklinis AMP.) Bazės taip pat gali būti metilinamos, kad susidarytų skirtingi molekulės.
Tiek DNR ir RNR naudokite keturias bazes, bet jos nenaudoja visų tų pačių. DNR naudoja adeniną, timiną, guaniną ir citoziną, o RNR naudoja adeniną, guaniną ir citoziną, tačiau vietoj timino turi uracilą. Molekulių spiralė susidaro, kai dvi viena kitą papildančios bazės sudaro vandenilinius ryšius. Adeninas jungiasi su timinu (A-T) DNR ir su uracilu RNR (A-U). Guaninas ir citozinas papildo vienas kitą (G-C).
Suformuoti nukleotidas, pagrindas jungiasi su pirmąja ar pirmine ribozės arba dezoksiribozės anglimi. Skaičius 5, kurio anglis yra cukrus, prisijungia prie fosfato grupės deguonies. DNR arba RNR molekulėse fosfatas iš vieno nukleotido sudaro fosfodiesterinį ryšį su 3 skaičiaus anglimi kitame nukleotido cukruje.
Cheminė adenino formulė yra C5H5N5. Adeninas (A) jungiasi su timinu (T) arba uracilu (U). Tai svarbi bazė, nes naudojama ne tik DNR ir RNR, bet ir energijos nešikliui molekulės ATP, kofaktoriaus flavino adenino dinukleotidas ir kofaktoriaus nikotinamido adeninas dinukleotidas (NAD).
Nors žmonės linkę nukleotidus vadinti savo bazių pavadinimais, adeninas ir adenozinas nėra tas pats dalykas. Adeninas yra purino bazės pavadinimas. Adenozinas yra didesnė nukleotido molekulė, sudaryta iš adenino, ribozės ar dezoksiribozės ir vienos ar daugiau fosfatų grupių.
Cheminė purino guanino formulė yra C5H5N5O. Guaninas (G) jungiasi tik su citozinu (C) tiek DNR, tiek RNR.
Citozinas gali savaime pasikeisti į uracilą. Jei mutacija nepataisoma, tai gali palikti uracilo likučius DNR.
Uracil yra a silpna rūgštis kurios cheminė formulė yra C4H4N2O2. Uracilis (U) randamas RNR, kur jis jungiasi su adeninu (A). Uracilis yra demetilinta bazinio timino forma. Molekulė perdirba save per fosforibosiltransferazės reakcijų rinkinį.