Pradėjus gyvuoti Žemėje evoliucija ir tampa sudėtingesni, paprastesni ląstelės tipas vadinamas prokariotu per ilgą laiką patyrė keletą pokyčių, kad taptų eukariotinėmis ląstelėmis. Eukariotai yra sudėtingesni ir turi daug daugiau dalių nei prokariotai. Prireikė kelių mutacijos ir išgyventi natūrali atranka kad eukariotai evoliucionuotų ir taptų paplitę.
Mokslininkai mano, kad kelionę nuo prokariotų iki eukariotų lėmė nedideli struktūros ir funkcijos pokyčiai per labai ilgą laiką. Yra logiškas pokyčių progresas, kad šios ląstelės taptų sudėtingesnės. Susikūrusios eukariotinės ląstelės, jos galėtų pradėti formuoti kolonijas ir ilgainiui daugialąstelinius organizmus su specializuotomis ląstelėmis.
Daugelis vienaląsčių organizmų turi ląstelių sienelę aplink savo plazmines membranas, kad apsaugotų juos nuo aplinkos pavojaus. Daugelis prokariotų, kaip ir tam tikros rūšies bakterijos, taip pat yra kapsuliuoti kitu apsauginiu sluoksniu, kuris taip pat leidžia jiems prilipti prie paviršių. Dauguma prokariotinių fosilijų iš
Prekambrijos laikotarpis yra bacilos arba lazdelės formos, su labai kieta ląstelės sienele, supančia prokariotą.Nors kai kurios eukariotų ląstelės, pavyzdžiui, augalų ląstelės, vis dar turi ląstelių sienas, daugelis jų neturi. Tai reiškia, kad kurį laiką per prokariotas, ląstelių sienos turėjo išnykti ar bent jau tapti lankstesnės. Lanksti ląstelės išorinė riba leidžia jai daugiau išsiplėsti. Eukariotų yra daug daugiau nei primityvesnių prokariotų ląstelių.
Lanksčios ląstelių ribos taip pat gali sulenkti ir sulankstyti, kad būtų sukurtas didesnis paviršiaus plotas. Ląstelė, kurios paviršiaus plotas yra efektyvesnis, keičiasi maistinėmis medžiagomis ir atliekomis su aplinka. Taip pat naudinga atvežti arba pašalinti ypač dideles daleles, naudojant endocitozę ar egzocitozę.
Eukariotų ląstelėje esantys struktūriniai baltymai sukuria sistemą, žinomą kaip citoskeletas. Nors terminas „skeletas“ paprastai atkreipia dėmesį į tai, kas sukuria objekto formą, citoskeletas eukariotų ląstelėje turi ir daug kitų svarbių funkcijų. Mikropluoštai, mikrotubulėliai ir tarpiniai pluoštai ne tik padeda išlaikyti ląstelės formą, bet ir plačiai naudojami eukariotuose. mitozė, maistinių medžiagų ir baltymų judėjimas ir organelių įtvirtinimas vietoje.
Mitozės metu mikrotubulėliai sudaro suklį, kuris traukia chromosomos išsiskiria ir paskirsto po lygiai dviem dukterinėms ląstelėms, susidarančioms po ląstelės suskaidymo. Ši citoskeleto dalis centrimere prisitvirtina prie seserinių chromatidžių ir tolygiai jas atskiria, todėl kiekviena gauta ląstelė yra tiksli kopija ir joje yra visi genai, reikalingi jai išgyventi.
Mikropluoštai taip pat padeda mikrotubuliams judinti maistines medžiagas ir atliekas, taip pat naujai pagamintus baltymus, esančius skirtingose ląstelės dalyse. Tarpiniai pluoštai išlaiko organeliukus ir kitas ląstelių dalis, tvirtindami juos ten, kur jie turi būti. Citoskeletas taip pat gali sudaryti žiedlapius, kad ląstelė judėtų.
Nors eukariotai yra vienintelės ląstelių rūšys, turinčios citoskeleto, prokariotinės ląstelės turi baltymus, kurie yra labai panašios struktūros į tuos, kurie naudojami citoskeletui sukurti. Manoma, kad šios primityvesnės baltymų formos patyrė keletą mutacijų, kurios privertė juos susilieti ir sudaryti skirtingus citoskeleto gabalus.
Plačiausiai naudojamas eukariotų ląstelės identifikavimas yra branduolio buvimas. Pagrindinis branduolio darbas yra patalpinti branduolį DNRarba genetinė ląstelės informacija. Prokariote DNR ką tik randama citoplazmoje, paprastai būna vieno žiedo formos. Eukariotuose yra branduolinio voko viduje esanti DNR, suskirstyta į kelias chromosomas.
Manoma, kad kai ląstelė sukūrė lanksčią išorinę ribą, kuri galėtų sulenkti ir sulankstyti, prokarioto DNR žiedas rastas netoli tos ribos. Kai jis buvo sulenktas ir sulankstytas, jis apjuosė DNR ir nuspaudė, kad taptų branduoliniu apvalkalu, supančiu branduolį, kuriame dabar buvo apsaugota DNR.
Laikui bėgant, vieno žiedo formos DNR evoliucionavo į sandarią žaizdos struktūrą, kurią dabar vadiname chromosoma. Tai buvo palanki adaptacija, todėl mitozės ar mejozės metu DNR nėra susipainiojusi ar netolygiai suskaidyta. Chromosomos gali atsiklijuoti ar subręsti priklausomai nuo to, kurioje ląstelės ciklo stadijoje ji yra.
Dabar, kai atsirado branduolys, išsivystė kitos vidinės membranos sistemos, tokios kaip endoplazminis retikulumas ir Golgi aparatas. Ribosomos, kurie anksčiau buvo tik laisvai plūduriuojantys prokariotuose, dabar yra tvirtinami prie endoplazminio retikulumo dalių, kad padėtų surinkti ir judėti baltymus.
Esant didesnei ląstelei, reikia daugiau maistinių medžiagų ir gaminti daugiau baltymų transkripcijos ir transliacijos būdu. Kartu su šiais teigiamais pokyčiais kyla ir daugiau atliekų ląstelėje problema. Kitas poreikis atsikratyti atliekų buvo kitas šiuolaikinės eukariotų ląstelės evoliucijos žingsnis.
Dėl lanksčios ląstelės ribos dabar buvo sukurtos visų rūšių raukšlės ir jos galėjo susikišti, jei reikia, kad susidarytų vakuumai dalelėms įnešti į ląstelę ir iš jos. Tai taip pat padarė kažką panašaus į produktų laikymo elementą ir atliekas, kurias ląstelė gamino. Laikui bėgant, kai kurie iš šių vakuolių sugebėjo sulaikyti virškinimo fermentą, galintį sunaikinti senas ar sužeistas ribosomas, neteisingus baltymus ar kitokio tipo atliekas.
Dauguma eukariotų ląstelių dalių buvo padarytos vienoje prokariotinėje ląstelėje ir nereikalavo kitų atskirų ląstelių sąveikos. Tačiau eukariotai turi pora labai specializuotų organelių, kurios, kaip manoma, kažkada buvo jų pačių prokariotinės ląstelės. Primityviosios eukariotų ląstelės turėjo galimybę įsisavinti daiktus per endocitozę, o kai kurie dalykai, kuriuos jie galėjo įsisavinti, atrodo mažesni prokariotai.
Žinomas kaip Endosimbiotikų teorija, Linas Margulis pasiūlė, kad mitochondrijos, arba ląstelės dalis, kuri sukuria naudingą energiją, kažkada buvo prokariotas, kurį primityvusis eukariotas buvo įsisavinęs, bet nesunaikintas. Be energijos gaminimo, pirmosios mitochondrijos tikriausiai padėjo ląstelei išgyventi naujesnę atmosferos formą, į kurią dabar įeina deguonis.
Kai kuriuose eukariotuose gali būti vykdoma fotosintezė. Šie eukariotai turi ypatingą organelę, vadinamą chloroplastu. Yra duomenų, kad chloroplastas buvo prokariotas, panašus į mėlynai žalius dumblius, kurie buvo prigludę panašiai kaip mitochondrijos. Kadaise tai buvo eukarioto dalis, eukariotas dabar galėjo gaminti savo maistą saulės spinduliais.