siRNR, reiškianti mažas trukdančias ribonukleino rūgštis, yra dvigrandžių RNR molekulių klasė. Tai kartais vadinama trumpa trukdančia RNR arba slopinančia RNR.
Mažos trukdančios RNR (siRNR) yra maži dvigubos grandinės (DS) RNR gabalai, paprastai apie 21 nukleotido ilgio, su 3 '(tariamais trijų pradmenų) iškyšuliais (dviem). nukleotidai) kiekviename gale, kurie gali būti naudojami „trukdyti“ baltymų transliacijai, prisijungiant prie pasiuntinių RNR (mRNR) ir skatinant jų skilimą specifinėse sekos.
siRNR funkcija
Prieš pasinerdami į tai, kas yra siRNR (nereikia painioti miRNR), svarbu žinoti RNR funkcijas. Ribonukleino rūgštis (RNR) yra nukleorūgštis, esanti visose gyvas ląsteles ir veikia kaip pasiuntinys, nešantis instrukcijas iš DNR, siekiant kontroliuoti baltymai.
Virusuose RNR ir DNR gali pernešti informaciją.
Tai darant, siRNR neleidžia gaminti specifinių baltymų, remiantis jų atitinkamos mRNR nukleotidų sekomis. Procesas vadinamas RNR interferencija (RNR) ir taip pat gali būti vadinamas siRNR nutildymu arba siRNR numušimu.
Iš kur jie kilę
SiRNR paprastai laikoma kilusi iš ilgesnių išorinių augimo grandinių arba kilusių iš organizmo išorės (RNR, kurią paima ląstelė ir kuri yra toliau apdorojama).
RNR dažnai kyla iš vektoriai, pvz., virusai ar transpozonai (genas, galintis pakeisti padėtį genome). Nustatyta, kad jie vaidina antivirusinę gynybą, per daug pagamintos mRNR ar mRNR, kurių transliacija buvo nutraukta, skilimą arba užkerta kelią genomo DNR ardymui per transpozonus.
Kiekviena siRNR grandinė turi 5 '(penkių pagrindinių) fosfato grupę ir 3' hidroksilo (OH) grupę. Jie gaminami iš dsRNR arba plaukų segtuko formos RNR, kuri, patekusi į ląstelę, padalijama į RNase III panašų fermentą, vadinamą Dicer, naudojant RNazę arba restrikcijos fermentai.
Tada siRNR yra įtraukiama į kelių subvienetų baltymų kompleksą, vadinamą RNR indukuotu triukšmo slopinančiu kompleksu (RISC). RISC „ieško“ tinkamos tikslinės mRNR, kur siRNR atsipalaiduoja ir, manoma, kad antisense kryptis nukreipia mRNR komplementarios grandinės skilimą, naudojant endo- ir egzonukleazės derinį fermentai.
Medicininis ir terapinis panaudojimas
Kai žinduolio ląstelė susiduria su dviguba grandine RNR, pavyzdžiui, siRNR, ji gali ją suklasifikuoti kaip viruso šalutinį produktą ir sukelti imuninį atsaką. Be to, siRNR įvedimas gali sukelti netyčinį taikymąsi, kai gali būti puolami ir išmušti kiti nepavojingi baltymai.
Į organizmą įnešus per daug siRNR, gali atsirasti nespecifinių reiškinių dėl įgimto imuninio atsako aktyvacija, tačiau atsižvelgiant į galimybę įveikti bet kurį dominantį geną, siRNR turi daug galimybių terapinis panaudojimas.
Daugelį ligų galima išgydyti slopinant genų ekspresiją, chemiškai modifikuojant siRNR, siekiant sustiprinti jų terapines savybes. Kai kurios savybės, kurias būtų galima patobulinti, yra:
- Patobulinta veikla
- Padidėjęs serumo stabilumas ir mažiau tikslinių rodiklių
- Sumažėjęs imunologinis aktyvumas
Todėl sintetinės siRNR projektavimas terapiniam naudojimui tapo populiariu daugelio biofarmacijos bendrovių tikslu.
Išsami visų tokių cheminių modifikacijų duomenų bazė rankiniu būdu kuruojama siRNAmod, rankiniu būdu kuriama duomenų bazė, kurioje yra eksperimentiškai patvirtintos chemiškai modifikuotos siRNR.