Mongolija yra aukšta, šalta ir sausa. Čia vyrauja ekstremalus žemyninis klimatas su ilgomis šaltomis žiemomis ir trumpomis vasaromis, kurių metu iškrenta daugiausia kritulių. Vidutiniškai šalyje per metus būna 257 debesuotos dienos, paprastai ji būna aukšto atmosferos slėgio regiono centre. Didžiausias kritulių kiekis yra šiaurėje, kur vidutiniškai būna nuo 20 iki 35 centimetrų per metus, ir mažiausias pietuose, kur gaunama nuo 10 iki 20 centimetrų (žr. 5). Labiausiai į pietus nutolęs Gobi, kai kuriuose regionuose per daugelį metų kritulių nebūna. Vardas Gobi yra mongolas, reiškiantis dykumą, depresiją, druskingą pelkę ar stepę, tačiau dažniausiai reiškiantis a sausringos kategorijos pievų kategorija, kurioje augmenijos nepakanka, kad būtų galima palaikyti uolas, bet kurių pakaktų kupranugariai. Mongolai atskirti gobi nuo tinkamos dykumos, nors skirtumas ne visada akivaizdus pašaliniams, nepažįstamiems Mongolijos kraštovaizdžio. Gobi kalnų viršūnės yra trapios ir lengvai sunaikinamos per ganant, todėl išsiplečia tikroji dykuma - akmeninės atliekos, kuriose net ir Bactrijos kupranugariai negali išgyventi.
Nuo lapkričio iki kovo mėnesio vidutinė oro temperatūra daugumoje šalių yra žemesnė, o balandžio ir spalio mėn. Sausio ir vasario mėn. Vidutinis -20 ° C vidurkis yra įprastas, daugiausiai metų būna -40 ° C žiemos naktys. Vasaros kraštutinumai siekia net 38 ° C pietiniame Gobi regione ir 33 ° C Ulaanbaatar mieste. Daugiau nei pusę šalies užima amžinasis įšalas, todėl statyba, kelių tiesimas ir kasyba apsunkina. Visos upės ir gėlo vandens ežerai žiemą užšąla, o mažesni upeliai paprastai užšąla iki dugno. Ulaanbataras yra 1 351 metro virš jūros lygio upės Tuul Gol slėnyje. Įsikūręs gana gerai girdomame šiaurėje, jis gauna vidutiniškai 31 centimetrą krituliai, beveik visa tai liepa ir rugpjūtis. Ulan Batore vidutinė metinė temperatūra yra –2,9 ° C, o šalčių laikotarpis vidutiniškai tęsiasi nuo birželio vidurio iki rugpjūčio pabaigos.
Mongolijos orai pasižymi dideliu kintamumu ir trumpalaikiu nenuspėjamumu vasarą, o kelių metų vidurkiai slepia didelius kritulių, datų skirtumus. šalnosir pūgų bei pavasarinių dulkių audrų atsiradimą. Tokie orai kelia rimtų iššūkių žmonių ir gyvulių išgyvenimui. Oficialioje statistikoje mažiau kaip 1 procentas šalies yra ariama, 8–10 procentų - miškas, o likusi dalis - ganykla ar dykuma. Grūdai, daugiausia kviečiai, auginami Selenge upės sistemos slėniuose šiaurėje, tačiau derlingumas svyruoja labai plačiai ir nenuspėjamai dėl lietaus kiekio ir laiko, taip pat dėl datų žudomos šalnos. Nors žiemos paprastai būna šaltos ir giedros, retkarčiais būna pūgos kurie neuždirba daug sniego, bet uždengia žolę pakankamai sniego ir ledo, kad ganymas būtų neįmanomas, užmušant dešimtis tūkstančių avių ar galvijų. Dėl tokių gyvulių nuostolių, kurie yra neišvengiami ir tam tikra prasme normalūs klimato padariniai, apsunkino planuojamą gyvulių skaičiaus padidėjimą.