Daugeliu atžvilgių šuns evoliucijos istorija seka tą patį plotmę kaip ir arkliai ir drambliai: maža, nekenksminga protėvių rūšis per dešimtis milijonų metų sukelia garbingą dydį palikuonių, kuriuos mes šiandien žinome ir mylime. Tačiau šiuo atveju yra du dideli skirtumai: pirma, šunys yra mėsėdžiai, o mėsėdžių evoliucija yra vingiuota, serpentino reikalas, apimantis ne tik šunis, bet ir priešistorines hiėjas, lokius, kates ir dabar išnykusius žinduolius, tokius kaip kreodontai ir mezonchidai. Antra, žinoma, šuns evoliucija smarkiai pasuko dešinėn maždaug prieš 15 000 metų, kai pirmieji vilkai buvo prijaukinti ankstyvieji žmonės.
Kiek gali pasakyti paleontologai, patys pirmieji mėsėdžiai žinduoliai išsivystė vėlyvuoju kreidos periodu, maždaug prieš 75 milijonus metų (labiausiai tikėtina, kad pusė svaro „Cimolestes“ gyveno aukštai medžiuose) kandidatas). Tačiau labiau tikėtina, kad kiekvienas šiandien gyvas mėsėdis gyvūnas gali atsekti savo protėvį iki Miacis, šiek tiek didesnis, į weasel panašus padaras, gyvenęs maždaug prieš 55 milijonus metų arba 10 milijonų metų po to, kai dinozaurai išėjo išnykęs. Vis dėlto Miacis buvo toli gražu ne bauginantis žudikas: šis mažytis kumeliukas taip pat buvo pavėsinė ir pasižymėjo vabzdžiais, kiaušiniais, taip pat mažais gyvūnais.
Prieš kanauninkus: kreodontai, mezonchidai ir draugai
Šiuolaikiniai šunys išsivystė iš mėsėdžių žinduolių, vadinamų „kanidais“, linijos, būdingos jų dantų formai. Tačiau prieš (ir greta) vidurius gyveno tokios įvairios plėšrūnų šeimos kaip amficionidai („meškos šunys“, kuriuos apibūdino Amphicikonas, kurie, atrodo, buvo labiau susiję su lokiais nei su šunimis), priešistorinės hiėjos (Ictitreium buvo pirmoji šios grupės gyvenimui žemėje, o ne medžiuose), o Pietų Amerikos ir Pietų Afrikos "marsupial šunims" Australija. Nors šie plėšrūnai neaiškios išvaizdos ir elgsenos, jie nebuvo tiesioginiai šiuolaikinių šunų protėviai.
Net baisesni nei meškos ir žandikaulių šunys buvo mezonichidai ir kreodontai. Garsiausi mesonichidai buvo vienos tonos Andrewsarchus, didžiausias kada nors gyvenęs žinduolių žinduolis ant žemės, mažesnis ir labiau į vilkus panašus Mesonyx. Kaip bebūtų keista, mezonichidai buvo protėviai ne šiuolaikiniams šunims ar katėms, bet priešistoriniai banginiai. Kreodontai, kita vertus, nepaliko gyvų palikuonių; buvo pastebimiausi šios veislės nariai Hiaenodonas ir stulbinamai pavadintas „Sarkastodon“, kurio pirmasis atrodė (ir elgėsi) kaip vilkas, o antrasis atrodė (ir elgėsi) kaip pilkšvas lokys.
Pirmieji viduriai: Hesperocitas ir „Kaulus graužiantys šunys“
Paleontologai sutinka, kad vėlai Eocenas (maždaug prieš 40–35 milijonus metų) Hesperocyon buvo protėvis visiems vėlesniems kanidams - taigi Canis genčiai, kuri išsišakojo iš kankorėžių porūšio maždaug prieš šešis milijonus metų. Šis „vakarinis šuo“ buvo tik maždaug mažos lapės dydžio, tačiau jo vidinė ausies struktūra buvo būdinga vėliau šunų, ir yra tam tikrų įrodymų, kad jis galėjo gyventi bendruomenėse, aukštai medžiuose ar požemiuose urvai. Hesperocitas labai gerai vaizduojamas iškasenų įraše; iš tikrųjų tai buvo vienas iš labiausiai paplitusių priešistorinės Šiaurės Amerikos žinduolių.
Kita ankstyvųjų kankorėžių grupė buvo borofaginai, arba „kaulus graužiantys šunys“, aprūpinti galingais žandikauliais ir dantimis, tinkamais nugruntuoti žinduolių megafaunos skerdenas. Didžiausi, pavojingiausi borofaginai buvo 100 svarų borofagai ir dar didesni Epicikonas; kitoms gentims buvo priskiriami ankstesni „Tomarctus“ ir „Aelurodon“, kurių dydis buvo labiau pagrįstas. Negalime tvirtai pasakyti, tačiau yra įrodymų, kad šie kaulus gniuždantys šunys (kurie taip pat buvo apriboti Šiaurės Amerika) medžiojo arba buvo išmaudyti pakuotėse, pavyzdžiui, šiuolaikinės hiénos.
Pirmieji tikrieji šunys: leptocianas, eukionas ir „Dire Wolf“
Čia viskas šiek tiek painu. Netrukus po „Hesperocyon“ pasirodymo prieš 40 milijonų metų, į sceną atvyko Leptocjonas - ne brolis, bet labiau panašus į antrą kartą sunaikintą pusbrolį. Leptocionas buvo pirmasis tikras kanopinis šunelis (tai yra, jis priklausė Canidae šeimos kanapių porūšiui), tačiau mažas ir nepastebimas, ne daug didesnis už patį Hesperocyon. Artimiausiam Leptocyono palikuoniui Eucynui pasisekė gyventi tuo metu, kai tiek Eurazija, tiek Pietų Amerika buvo pasiekiami iš Šiaurės Amerikos - pirmasis per Beringą sausumos tiltas, ir antrasis dėka atidengtos Centrinės Amerikos. Šiaurės Amerikoje maždaug prieš šešis milijonus metų Eukjono populiacijos išsivystė į pirmuosius modernios šunų genties „Canis“ narius, kurie išplito šiuose kituose žemynuose.
Tačiau pasaka tuo nesibaigia. Nors kanopiniai šunys (įskaitant pirmuosius kojotus) Šiaurės Amerikoje ir toliau gyveno Plioceno epocha, pirmieji plius dydžio vilkai išsivystė kitur ir „vėl įsiveržė“ į Šiaurės Ameriką prieš pat jų atsiradimą Pleistocenas (per tą patį Beringo sausumos tiltą). Garsiausias iš šių šunų buvo Dire Vilkas, „Canis diris“, kuris išsivystė iš „senojo pasaulio“ vilko, kuris kolonizavo tiek Šiaurės, tiek Pietų Ameriką (beje, „Dire Wolf“ tiesiogiai varžėsi dėl grobio su Smilodonas, „tigras, kurio dantys dantys“.)
Pleistoceno epochos pabaiga liudijo žmogaus civilizacijos kilimą visame pasaulyje. Kiek mes galime pasakyti, pirmasis prijaukinimas Pilkas vilkas įvyko kažkur Europoje ar Azijoje prieš 30 000–15 000 metų. Po 40 milijonų evoliucijos metų šiuolaikinis šuo pagaliau debiutavo.