RNR apibrėžimas ir pavyzdžiai

RNR yra akronimas ribonukleino rūgščiai. Ribonukleino rūgštis yra a biopolimeras naudojamas koduoti, iššifruoti, reguliuoti ir išreikšti genai. RNR formos apima pasiuntinio RNR (mRNR), pernešančiosios RNR (tRNR) ir ribosominės RNR (rRNR). RNR kodai amino rūgštis sekos, kurios gali būti sujungtos į formą baltymai. Kai naudojama DNR, RNR veikia kaip tarpininkas, perrašydamas DNR kodą, kad jį būtų galima perkelti į baltymus.

RNR sudaro nukleotidai, sudaryti iš ribozės cukraus. Anglies atomai cukruje pažymėti nuo 1 iki 5. Prie cukraus 1 'anglies yra prijungtas purinas (adeninas arba guaninas) arba pirimidinas (uracilis arba citozinas). Tačiau, nors RNR transkriptuojama naudojant tik šias keturias bazes, jos dažnai modifikuojamos, kad būtų gauta daugiau kaip 100 kitų bazių. Tai apima pseudouridiną (Ψ), ribotimidiną (T nereikia supainioti su Tmino tirpalu DNR DNR), hipoksantiną ir inoziną (I). Fosfato grupė, prijungta prie vienos ribozės molekulės 3 'anglies, prisijungia prie kitos ribozės molekulės 5' anglies. Kadangi fosfato grupės ant ribonukleino rūgšties molekulės turi neigiamus krūvius, RNR taip pat įkraunama elektra. Tarp adenino ir uracilo, guanino ir citozino, taip pat guanino ir uracilo, susidaro vandenilio ryšiai. Šie vandenilio ryšiai sudaro struktūrinius domenus, tokius kaip plaukų segtuko kilpos, vidinės kilpos ir išsikišimai.

Tiek RNR ir DNR yra nukleorūgštys, tačiau RNR naudoja monosacharidą ribozę, o DNR yra paremta cukraus 2'-dezoksiriboze. Kadangi RNR turi papildomą hidroksilo grupę ant cukraus, ji yra labiau labili nei DNR, pasižyminti mažesne hidrolizės aktyvacijos energija. RNR naudoja azotines bazes adeniną, uracilą, guaniną ir timiną, o DNR naudoja adeniną, timiną, guaniną ir timiną. Be to, RNR dažnai yra vienos grandinės molekulė, o DNR yra dvigubos grandinės spiralė. Tačiau ribonukleino rūgšties molekulėje dažnai yra trumpi spiralių skyriai, kurie užlenkia molekulę savyje. Ši supakuota struktūra suteikia RNR gebėjimą veikti kaip katalizatorius panašiai, kaip baltymai gali veikti kaip fermentai. RNR dažnai susideda iš trumpesnių nukleotidų sruogų nei DNR.

Yra 3 pagrindiniai RNR tipai:

• Messenger RNR arba mRNR: mRNR perduoda informaciją iš DNR į ribosomas, kur ji perkeliama gaminant baltymus ląstelei. Tai laikoma koduojančiu RNR tipu. Kas trys nukleotidai sudaro vienos aminorūgšties kodoną. Kai aminorūgštys jungiasi ir modifikuojamos po vertimo, gaunamas baltymas.
• Perkelkite RNR arba tRNR: tRNR yra trumpa maždaug 80 nukleotidų grandinė, kuri naujai suformuotą aminorūgštį perkelia į augančios polipeptido grandinės pabaigą. TRNR molekulė turi antikodono skyrių, atpažįstantį aminorūgščių kodonus ant mRNR. Taip pat molekulėje yra aminorūgščių prisijungimo vietos.
• Ribosominė RNR arba rRNR: rRNR yra dar viena RNR rūšis, susijusi su ribosomomis. Žmonėse ir kituose eukariotuose yra keturi rRNR tipai: 5S, 5.8S, 18S ir 28S. rRNR sintezuojama ląstelės branduolyje ir citoplazmoje. rRNR susijungia su baltymais, kad sudarytų ribosomą citoplazmoje. Tada ribosomos suriša mRNR ir atlieka baltymų sintezę.

Be mRNR, tRNR ir rRNR, organizmuose yra ir daugybė kitų ribonukleino rūgšties rūšių. Vienas iš būdų jas suskirstyti į grupes yra jų vaidmuo baltymų sintezėje, DNR replikacijoje ir po transkripcijos modifikavime, genų reguliavime ar parazitizme. Kai kurie iš šių kitų RNR tipų yra:

• RNR arba tmRNR: tmRNR randama bakterijose ir vėl pradeda sustoti ribosomos.
• Maža branduolinė RNR arba snRNR: snRNR randama eukariotuose ir archajoje ir veikia splaisinguose.
• Telomerazės RNR komponentas arba TERC: TERC randamas eukariotuose ir telomerų sintezės funkcijose.
• Patobulinanti RNR arba eRNR: eRNR yra genų reguliavimo dalis.
• Retrotransposonas: Retrotransposonai yra savaime plintančios parazitinės RNR rūšis.

• Barciszewski, J.; Frederic, B.; Clarkas, C. (1999). RNR biochemija ir biotechnologija. Springeris. ISBN 978-0-7923-5862-6.
• Bergas, J.M.; Tymoczko, J.L.; Stryeris, L. (2002). Biochemija (5-asis leidimas). WH Freeman ir kompanija. ISBN 978-0-7167-4684-3.
• Cooperis, G.C.; Hausmanas, R.E. (2004). Ląstelė: molekulinis požiūris (3-asis leidimas). Sinaueris. ISBN 978-0-87893-214-6.
• Söll, D.; „RajBhandary“, U. (1995). tRNR: struktūra, biosintezė ir funkcija. „ASM Press“. ISBN 978-1-55581-073-3.
• „Tinoco“, I.; Bustamante, C. (1999 m. Spalis). „Kaip sudedama RNR“. Žurnalas apie molekulinę biologiją. 293 (2): 271–81. doi: 10.1006 / jmbi.1999.3001